Empregos atuais relacionados a Bioinformata Júnior - Salvador, Bahia - Cidacs

Você é um(a) bioinformata em início de carreira, com vontade de aprender, crescer profissionalmente e atuar em um ambiente de alta complexidade técnica? Gosta de trabalhar com dados genômicos, aprender novas ferramentas e contribuir para a construção de soluções que farão parte de um projeto nacional estratégico? Então esta vaga pode ser para você.

O Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde (Cidacs/Fiocruz Bahia) está recrutando um(a) Bioinformata Júnior para atuar no Piloto do Repositório Nacional de Dados Genômicos do Programa Genomas Brasil, projeto prioritário do Ministério da Saúde/DECIT. Você fará parte de uma equipe multidisciplinar responsável pela criação da base técnica, metodológica e arquitetural que dará origem ao repositório nacional que integrará dados genômicos, fenotípicos e clínicos de projetos financiados pelo DECIT.

Sua atuação será estratégica: você definirá arquiteturas, implementará e validará pipelines modernos em HPC, estabelecerá padrões de qualidade para sequências e metadados, e liderará a publicação de catálogos, ontologias e esquemas de versionamento e reprodutibilidade — seguindo padrões GA4GH e melhores práticas globais.

A vaga poderá ser REMOTA ou presencial, na sede do CIDACS localizada no Parque Tecnológico da Bahia – Edifício Tecnocentro, Rua Mundo 121, Trobogy.

Responsabilidades e atribuições

• Apoio no desenho e implementação de pipelines de bioinformática: Colaborar no desenvolvimento e na execução de pipelines reprodutíveis (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes), utilizando containers e aprendendo melhores práticas internacionais (GATK Best Practices, nf-core), sempre com supervisão da equipe mais experiente.
• Suporte na definição de métricas e painéis de QC: Apoiar a equipe na verificação da qualidade de sequências (FASTQ/BAM/VCF) e metadados clínico-fenotípicos, auxiliando no cálculo de métricas, organização de relatórios e identificação inicial de possíveis inconsistências.
• Auxílio em rotinas de automação: Contribuir para a criação e manutenção de rotinas automatizadas para ingestão e validação de dados, seguindo modelos, scripts e frameworks já utilizados pela equipe, com foco em padronização e eficiência.
• Apoio à consolidação de catálogos e metadados: Participar da organização e atualização de catálogos de variantes e metadados, ajudando em tarefas de indexação, versionamento e harmonização de informações conforme ontologias e padrões reconhecidos.
• Colaboração na elaboração de Procedimentos Operacionais Padrão (SOPs): Ajudar na preparação de documentos técnicos, guias e templates, contribuindo para a padronização e reprodutibilidade dos processos, com orientação da equipe técnica.
• Participação na documentação dos processos e pipelines: Auxiliar na criação e manutenção da documentação das soluções implementadas, garantindo clareza, organização e apoio ao trabalho da equipe, contribuindo para a rastreabilidade e evolução futura dos processos.

Requisitos e qualificações

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QUALIFICAÇÕES E REQUISITOS OBRIGATÓRIOS:

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FORMAÇÃO:

• Graduação completa em Bioinformática, Biologia, Biotecnologia, Computação, Engenharia Biomédica ou áreas correlatas OU especialização/mestrado em áreas relacionadas à genômica, biologia computacional ou análise de dados biomédicos.

EXPERIÊNCIA:

• Experiência prévia de pelo menos 1 ano em bioinformática (projetos acadêmicos, iniciação científica, estágios, ICs, TCCs, participações em laboratórios ou grupos de pesquisa).
• Experiência básica com pipelines ou etapas bioinformáticas (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes).
• Participação em projetos ou atividades envolvendo dados genômicos, exoma ou painéis — acadêmicos ou profissionais.

HABILIDADE TÉCNICAS:

• Conhecimento inicial de Nextflow e/ou WDL/Cromwell, com disposição para aprofundamento e aprendizado prático.
• Familiaridade com ferramentas essenciais: BWA, samtools/bcftools, Picard, FastQC, mesmo que aplicada em contextos acadêmicos.
• Interesse e noções básicas sobre ontologias biomédicas (HPO, SNOMED, OMOP) ou metadados clínicos.
• Experiência inicial com containers (Docker ou Singularity/Apptainer).
• Noções de QC e curadoria de dados genômicos (ex.: uso de FastQC, MultiQC).
• Conhecimento básico de ambientes Linux e Shell Script.
• Familiaridade com Git e versionamento de código.
• Interesse em aprender sobre execução em HPC (SLURM, filas, quotas).

HABILIDADE INTERPESSOAIS:

• Boa capacidade de organização e aprendizado contínuo.
• Abordagem analítica e curiosidade científica.
• Facilidade para trabalhar em equipe multidisciplinar.
• Comunicação clara e abertura para receber orientação técnica.

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DESEJÁVEIS, MAS NÃO OBRIGATÓRIOS:

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OUTRAS QUALIFICAÇÕES:

• Conhecimento introdutório sobre padrões GA4GH (ex.: já ter lido ou utilizado Phenopackets, DUO, htsget).
• Experiência prévia com ferramentas de coleta e organização de dados clínicos/fenotípicos (ex.: REDCap).
• Inglês básico ou intermediário para leitura de documentação técnica.

DIFERENCIAIS:

• Publicações acadêmicas, posters ou apresentações em eventos científicos.
• Participação em competições, hackathons ou cursos avançados de bioinformática.

Informações adicionais

SOBRE O PROJETO:

Nos próximos 24 meses, vamos transformar milhares de sequências genômicas dispersas em um repositório nacional vivo, seguro e interoperável — com pipelines Nextflow/WDL executando em HPC, controle de qualidade rigoroso e metadados harmonizados.

Estamos construindo o primeiro piloto do Repositório Nacional Genômico, integrando dados genômicos, fenotípicos e clínicos provenientes de projetos financiados pelo DECIT/MS, criando a base para pesquisas em saúde pública, vigilância genômica e medicina de precisão.

Buscamos pessoas inquietas, altamente técnicas e comprometidas com a ciência aberta e o uso ético de dados sensíveis que desejam contribuir para uma das iniciativas mais estratégicas do país em genômica humana.

SOBRE O CIDACS:

O CIDACS é um centro pioneiro na integração de dados, focado em entender, estudar e avaliar as condições de saúde da população brasileira por meio de Big Data. Nosso trabalho auxilia gestores públicos, pesquisadores e a comunidade, contribuindo para transformar vidas. Se você, assim como nós, é apaixonado por tecnologia e inovação, junte-se ao nosso time. Aqui, você encontrará um ambiente acolhedor, propício para desenvolvimento e inovação, repleto de profissionais de diversas formações acadêmicas unidos por um propósito.

Aqui você encontrará:

• Um ambiente acolhedor e colaborativo;
• Profissionais altamente qualificados e multidisciplinares;
• Infraestrutura de ponta (HPC, data lake seguro, TRE);
• Incentivo à inovação, formação contínua e autonomia científica.

Se você é apaixonado por bioinformática, automação e desafios complexos, venha fazer parte dessa missão.

Traga seu talento e comprometimento e venha fazer parte desse time

Mais informações sobre o Cidacs, acesse:

O Cidacs conduz estudos e pesquisas baseados em projetos interdisciplinares originados na vinculação de grandes volumes de dados para ampliar o entendimento dos determinantes e das políticas sociais e ambientais sobre a saúde da população.