Bioinformata Pleno
2 semanas atrás
O Cidacs conduz estudos e pesquisas baseados em projetos interdisciplinares originados na vinculação de grandes volumes de dados para ampliar o entendimento dos determinantes e das políticas sociais e ambientais sobre a saúde da população.QUALIFICAÇÕES E REQUISITOS OBRIGATÓRIOS :FORMAÇÃO :Mestrado em Bioinformática ou áreas correlatas envolvendo ciências da saúde, biologia computacional, genética, ciência de dados biomédicos ou informática aplicada à genômica humana.EXPERIÊNCIA :Mínimo de 3 anos em bioinformática (acadêmica ou profissional), com atuação comprovada em genômica.Experiência sólida no desenho, implementação, operação e otimização de pipelines reprodutíveis (pré-processamento, mapeamento, chamadas de variantes, joint-genotyping etc.).Participação prévia como bioinformata em projetos de genômica.HABILIDADE TÉCNICAS :Experiência prática com Nextflow e / ou WDL / Cromwell, incluindo execução em ambientes HPC.Domínio de ferramentas essenciais : GATK, BWA, samtools / bcftools, Picard.Uso de ontologias biomédicas (HPO, SNOMED, OMOP) ou experiência em mapeamento de metadados clínicos.Experiência com containers (Docker, Singularity / Apptainer).Vivência em QC e curadoria de dados genômicos.Conhecimento de ambientes HPC (SLURM, filas, quotas, logs, storage distribuído).Sólida experiência em Linux e Shell Script.Experiência com Git, versionamento, CI / CD e boas práticas de engenharia de software.HABILIDADE INTERPESSOAIS :Abordagem analítica e orientada à solução de problemas.Capacidade de trabalhar em ambiente colaborativo e de alta responsabilidade científica.DESEJÁVEIS, MAS NÃO OBRIGATÓRIOS :OUTRAS QUALIFICAÇÕES :Experiência com padrões GA4GH (htsget, refget, DUO, Phenopackets).Experiência no uso de ferramentas e estrutura de dados para registro de dados fenotípicos como RedCAP.Familiaridade com modelos de dados clínicos, especialmente OMOP-CDM.Inglês intermediárioDIFERENCIAIS :Doutorado em Bioinformática ou áreas correlatas.Publicações científicas relevantes em genômica ou bioinformática.Experiência prévia em projetos nacionais ou multicêntricos de grande escala.Experiência com pipelines nf-core, HAIL ou Spark genômico.Conhecimento de processamento em GPU e Nvidia Parabricks em genômica.TAREFAS PRINCIPAIS :Desenho e implementação de pipelines de bioinformática : Projetar pipelines reprodutíveis (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes, gVCF, joint-calling) utilizando containers e seguindo melhores práticas internacionais (GATK Best Practices, nf-core).Definir painéis / métricas de QC : Estabelecer métricas de qualidade para sequências (FASTQ / BAM / VCF) e metadados clínico-fenotípicos, definindo thresholds, alertas e relatórios.Automatização : Desenvolver rotinas automatizadas para ingestão, auditoria e curadoria, garantindo eficiência, padronização e rastreabilidade.Consolidar catálogos e metadados : Apoiar a construção de catálogos agregados de variantes (frequências populacionais), indexação e versionamento de metadados conforme ontologias reconhecidas (HPO, SNOMED-CT, OMOP, GA4GH).Procedimentos Operacionais Padrão (SOPs) : Elaborar documentos técnicos, guias e templates para garantir governança, auditoria e reprodutibilidade dos processos.Documentação robusta : Criar e manter documentação completa e clara, garantindo que pipelines e procedimentos possam ser mantidos, auditados e evoluídos pela equipe no futuro.#J-*****-Ljbffr
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Bioinformata Pleno
Há 7 dias
Salvador, Brasil Cidacs Fiocruz Bahia Tempo inteiroJoin to apply for the Bioinformata Pleno role at Cidacs / Fiocruz BahiaVocê é um(a) bioinformata com mais de 3 anos de experiência, alta autonomia, capacidade de liderar soluções complexas e maturidade técnica para tomar decisões informadas em ambientes computacionais de alto desempenho com responsabilidade?Consegue navegar entre desafios intrincados,...
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Bioinformata Pleno
1 semana atrás
Salvador, Brasil Cidacs Fiocruz Bahia Tempo inteiroJoin to apply for the Bioinformata Pleno role at Cidacs / Fiocruz Bahia Você é um(a) bioinformata com mais de 3 anos de experiência , alta autonomia, capacidade de liderar soluções complexas e maturidade técnica para tomar decisões informadas em ambientes computacionais de alto desempenho com responsabilidade? Consegue navegar entre desafios...
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2 semanas atrás
Salvador, Brasil Plataforma de Dados do Cidacs Tempo inteiroJob description Você é um(a) bioinformata com mais de 3 anos de experiência , alta autonomia, capacidade de liderar soluções complexas e maturidade técnica para tomar decisões informadas em ambientes computacionais de alto desempenho com responsabilidade? Consegue navegar entre desafios intrincados, propor caminhos e construir soluções robustas que...
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2 semanas atrás
Salvador, Brasil Plataforma De Dados Do Cidacs Tempo inteiroJob descriptionVocê é um(a) bioinformata com mais de 3 anos de experiência, alta autonomia, capacidade de liderar soluções complexas e maturidade técnica para tomar decisões informadas em ambientes computacionais de alto desempenho com responsabilidade?Consegue navegar entre desafios intrincados, propor caminhos e construir soluções robustas que...
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2 semanas atrás
Salvador, Brasil Plataforma De Dados Do Cidacs Tempo inteiroJob descriptionVocê é um(a)bioinformata com mais de 3 anos de experiência, alta autonomia, capacidade de liderar soluções complexas e maturidade técnica para tomar decisões informadas em ambientes computacionais de alto desempenho com responsabilidade?Consegue navegar entre desafios intrincados, propor caminhos e construir soluções robustas que...
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2 semanas atrás
Salvador, Brasil Cidacs Tempo inteiro--------------------------------------------------QUALIFICAÇÕES E REQUISITOS OBRIGATÓRIOS:--------------------------------------------------FORMAÇÃO:Mestrado em Bioinformática ou áreas correlatas envolvendo ciências da saúde, biologia computacional, genética, ciência de dados biomédicos ou informática aplicada à genômica...
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2 semanas atrás
Salvador, Brasil Netvagas Tempo inteiro--------------------------------------------------QUALIFICAÇÕES E REQUISITOS OBRIGATÓRIOS:--------------------------------------------------FORMAÇÃO:Mestrado em Bioinformática ou áreas correlatas envolvendo ciências da saúde, biologia computacional, genética, ciência de dados biomédicos ou informática aplicada à genômica...
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2 semanas atrás
SALVADOR, Brasil Cidacs Tempo inteiro-------------------------------------------------- QUALIFICAÇÕES E REQUISITOS OBRIGATÓRIOS: -------------------------------------------------- FORMAÇÃO: Mestrado em Bioinformática ou áreas correlatas envolvendo ciências da saúde, biologia computacional, genética, ciência de dados biomédicos ou informática aplicada à genômica humana....
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Há 7 dias
Salvador, Brasil Cidacs Tempo inteiroO Cidacs conduz estudos e pesquisas baseados em projetos interdisciplinares originados na vinculação de grandes volumes de dados para ampliar o entendimento dos determinantes e das políticas sociais e ambientais sobre a saúde da população. /n-------------------------------------------------- QUALIFICAÇÕES E REQUISITOS OBRIGATÓRIOS:...
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2 semanas atrás
Salvador, Brasil Cidacs Tempo inteiroO Cidacs conduz estudos e pesquisas baseados em projetos interdisciplinares originados na vinculação de grandes volumes de dados para ampliar o entendimento dos determinantes e das políticas sociais e ambientais sobre a saúde da população. QUALIFICAÇÕES E REQUISITOS OBRIGATÓRIOS : FORMAÇÃO : Mestrado em Bioinformática ou áreas correlatas...
